简介
现代奥林匹克运动创始人皮埃尔·德·顾拜旦男爵于光绪21年致函李鸿章，劝说中国清政府参加首届世界运动会（万国运动会）。 该剧由此传说出发，围绕一个一心报国却被明升暗降调离战场的将军、一个满腹经纶却遇科举废除的秀才、一个被立了贞洁牌坊的天桥寡妇和一个留学西洋满脑子反传统观念的皇家格格等，从背景到性格都千差万别的各路男女壮士，讲述他们误打误撞进入中国最早的运动队，凭一张嘴混迹天桥，贩卖假洋古董的杨天樵是这些众壮士的坚实后盾。 他们冲破清政府的重重阻挠，最终壮志满怀地出征万国运动会，结果却发现大会已经闭幕。此剧在碰撞出现代体育精神与中国传统文化火花的同时，也展现了清末一群青年人的报国热情和他们对美好生活和爱情的追求。。小智、皮卡丘、长尾怪手终于到达神奥地方。小智在打电话给大木博士的途中遇到了火箭队的突袭而同皮卡丘失散，便与长尾怪手立刻出发寻找皮卡丘的身影；另一方面，新人训练家小光的妈妈彩子曾是顶尖协调训练家，小光亦想成为顶尖协调训练家，于是由双叶镇出发展开路程。在其后，小智的同伴小刚归队，二人邂逅了小光。自此，三人一同结伴旅行。
几经辛苦，小光终于集齐5枚缎带徽章，她在神奥华丽大型庆典表示出色，首次参加便晋级至决赛，但在决赛以稍微差距败于好友小望；小智亦集齐8枚徽章，他在神奥联盟有好开始，在第1回战打败尚志，第2回战打败某女路人，第3回战(16强)打败考平，8强更打败真司，可是他无法势如破竹而在准决赛惨败于达克多，4强出局。
神奥之旅随着神奥联盟结束而来到尾声，小智及小刚曾邀请小光一同前往关都地方，但小光因卷卷耳被邀请而不能前来，当天日落，小智在码头上和小光以最后一次击掌道别，与皮卡丘及小刚乘船返回关都地方。翌日日出后，小智和小刚回到关都地方，在往真新镇及尼比市的分叉路口，小智和小刚握手及互相祝福对方后正式告别。小智和皮卡丘终于看见真新镇，他们跑进返回真新镇前的最后一段路，神奥之旅正式划上句号。。