简介
在消灭108名恶路程式的三个月后，泊进之介（假面骑士驰骑）与诗岛雾子因接受调查频发异常现象的命令，而来到“不可思议现象研究所”所在的大天空寺院与月村朱里及御成等人进行接触。
不过这时天空寺尊（假面骑士灵骑）为夺回被上级眼魔偷取的幽灵眼魂而战斗，但进之介因看不见眼魔而误会对方故意玩闹，后来加上诗岛刚（假面骑士冥骑）与深海诚（假面骑士魂骑），及进之介这时拿到冥骑驱动炎变身参战之下更混成一堆，此时朱里使用“不知火”让眼魔现身才打破这个乱局，四人继而合作将敌人击倒并夺回眼魂。。搜查二系是警视厅里备受冷落的所在，虽说顶着“专门负责处理久而未决的案件”的头衔，其实部门里的人都在混日子。直到有一天，东大高材生柴田纯（中谷美纪饰）加入，柴田纯具有罕见的运算和分析能力，破案的过程可谓惊心动魄，但另一方面，她是个非常单纯的生活白痴，同事真山彻（渡部笃郎饰）是她的拍档兼保姆，照顾着脱线的柴田。
真山的身上背负着一个沉重的过去，7年前，妹妹被轮暴，可是凶手始终没抓到，柴田开始重新调查这一事件，却发现过去的种种混杂交织在一起，怎么也拨不开这层迷雾……。