本片改编自同名漫画，讲述了高中教师原美铃一边隐瞒与好友美奈子的未婚夫早藤的关系，一边从讲台的高处俯视观察学生们，偷偷地满足自尊心。但是，假装平静的日常生活因为自己班上的男学生·新妻的事件而开始崩溃…。故事的舞台是在战争中被破坏的基地殖民地、飘荡着大量战舰的残骸的“Thunderbolt宙域”，宙域是对ZEON公国要塞“A Bao A Qu”的补给道路，为了夺回宙域，地球连邦军和ZEON公国展开了激烈的战斗。地球连邦军的伊奥·弗莱明少尉等人乘坐GM204F，潜入Thunderbolt宙域，向狙击手发起了挑战。。